Fakültemiz 3 bölümden oluşmaktadır. 

Temel Eczacılık Bilimleri Bölümü, Analitik Kimya Anabilim Dalı, Biyokimya Anabilim Dalı, Eczacılık Temel Bilimleri Anabilim Dalı, Farmasötik Mikrobiyoloji Anabilim Dallarına sahiptir. 

Eczacılık Teknolojisi Bölümü, Farmasötik Teknoloji Anabilim Dalı, Farmasötik Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Radyofarmasi Anabilim Dallarından oluşmaktadır. 

Eczacılık Meslek Bilimleri Bölümü, Farmasötik Kimya Anabilim Dalı, Farmakoloji Anabilim Dalı, Farmasötik Botanik Anabilim Dalı, Farmakognozi Anabilim Dalı, Farmasötik Toksikoloji Anabilim Dalı, Eczacılık İşletmeciliği Anabilim Dallarını içermektedir.